Зародившись в условиях репрессий как система выживания, под влиянием сложившихся социально-исторических условий ниндзюцу постепенно превратилось в секретное искусство шпионажа. Если в начале целью для его адептов ставилась защита жизни собратьев, то позднее основной целью стали заказные убийства и диверсии.

Являясь неотъемлемой частью богатого в своей духовности учения и служа благородным целям, это секретное воинское искусство находило горячую поддержку и содействие в широких массах. Но с течением времени одно лишь упоминание о ниндзя стало вселять в людей смертельный ужас.

Конечно, отношение к «ночным воинам» может быть различным. Но несомненно одно: это были бесстрашные воины, в совершенстве владевшие уникальным воинским искусством, готовые ценой собственной жизни выполнить задание любой сложности. Их изобретательности, сообразительности и смекалке не было границ. Пожалуй, мало кто еще внес в развитие военной науки такой вклад как ниндзя, начиная от разработки всевозможных видов оружия до создания совершенных тактик ведения боя.

Система подготовки воинов ниндзюцу, по мнению многих, была сильно извращена в моральном смысле: тайным воинам были чужды такие понятия как порядочность, сострадание, ненависть, честь и т.п. И это не удивительно. Ведь все это могло бы быть серьезным препятствием в их деятельности: порядочность не позволила бы им браться за любой род заданий, сострадание могло привести к собственной гибели, ненависть мешала объективной оценке противника, чувство собственного достоинства могло быть помехой Для выполнения приказа. Главным мерилом эффективности действий ниндзя служил результат. Воин не мог позволить себе никаких слабостей и излишеств, ведь ценой ошибки была его жизнь. У воина ниндзюцу не могло быть друзей, были лишь партнеры, которые зачастую превращались в противников.

Сам термин ниндзюцу (нин - невидимый, терпеливый; дзюцу - искусство) допускает два толкования: «искусство быть невидимым» и «искусство терпеть». Таким образом, ниндзя должен был быть невидимым, (точнее сказать, невидимым должно было быть его искусство) и терпеливым, т.к. терпеть ему приходилось всю свою жизнь, начиная с жесточайших тренировок и кончая пытками в плену врага.